En Foco: Ian Burbulis
En la búsqueda de un diagnóstico precoz en el cáncer de ovarios y páncreas
Licenciado en Ciencias de Biología y Química, Universidad Virginia Tech (EE.UU.), donde realizó su doctorado bajo la dirección de Brenda Winkel, investigando interacciones proteína-proteína que facilitan el montaje de complejos multienzimáticos para canalizar el flujo de los productos químicos intermedios como en la síntesis de flavonoides.
Realizó un post-doctorado con Sydney Brenner y Roger Brent en el Instituto de Biología Molecular (MSI), ubicado en Berkeley, CA (EE.UU.) donde desarrolló estrategias químicas para la síntesis de nuevas clases de moléculas de fusión de semi-orgánicos. Este trabajo generó varias patentesy publicaciones que condujeron al investigador a una posición permanente en el MSI.
Es socio fundador de la empresa biotecnológica Green Pacific Biologicals, Inc. (Berkeley, CA), empresa que se focaliza en manipular la síntesis de “carbono neutro” en algas para combustión.
En 2011, colabora en la fusión del MSI con el Centro de Investigación Técnica de Finlandia (VTT) (considerado el brazo científico del gobierno finlandés y la mayor organización de investigación) para formar el VTT / MSI Molecular Sciences Research Institute (Berkeley, CA. EE.UU.) .
El 2013 se une al departamento de Bioquímica y Genética Bioquímica de la Facultad de Medicina de la Universidad de Virginia, donde desarrolló una investigación para crear nuevas metodologías para la secuenciación del genoma de una sola célula.
Ha trabajado como asesor de numerosas empresas de biotecnología ligadas a universidades y en la actualidad es miembro de la junta ejecutiva de Full Genomes, Inc. (USA).
Su trabajo ha recibido el apoyo del National Institutes of Health (USA), a través de numerosas becas así como contratos de investigación. Además ha colaborado en la revisión de artículos de variadas revistas de investigación.
Entre sus líneas de investigación el Dr Burbullis desarrolla herramientas para aplicaciones biotecnológicas. En su laboratorio se ejecuta investigación básica para generar aplicaciones novedosas. El tema central de su trabajo es entender cómo la información genómica se expresa cuantitativamente para formar sistemas bioquímicos complejos. A este respecto, se estudia el rol del mosaiquismo genómico somático durante el desarrollo de la vida humana y la diferenciación neuronal, específicamente cómo la variación en el contenido genómico de célula a célula afecta la homeostasis de la transcripción (expresión génica). Para estos estudios se han desarrollado métodos de secuenciación del genoma y el transcriptoma a una sola célula.
De esta manera se han descubierto varios perfiles de glicosilación aberrantes de proteínas circulantes en la sangre, y se está investigando si esto tiene impacto en un diagnóstico precoz del cáncer de ovario y de páncreas. Para estos estudios se inventó un nuevo tipo de sonda (Tadpole) útil para cuantificar y caracterizar los cambios estructurales en los biomarcadores de baja abundancia con lo cual predecir el estado de salud.
También ha desarrollado estrategias químicas de amplificación de señal para poder crear sistemas de diagnóstico precoz (LAMPoles).
Además, está involucrado en estudios para manipular el flujo de carbono en microalgas fotosintéticas hacia la síntesis de triglicéridos (y otras vías) como una plataforma para la fabricación de compuestos de interés industrial.
Entre sus redes de Colaboración se encuentran:
- Dennis Grab (The Johns Hopkins University, USA)
- Mike McConnell (University of Virginia, USA)
- Stefan Magez (IUB, Belgium)
- Richard Yu (University of California, San Francisco, USA)
- Roger Brent (FHCRC, USA)
- Fred (Rusty) Gage (Salk Institute, USA)
- Sydney Brenner (Salk Institute, USA)
Carolina Gallegos/Difusión Científica USS